Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms