Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms