Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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