Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SUSD3Q96L08 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SUSD3Q96L08 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SUSD3Q96L08 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SUSD3Q96L08 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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