Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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