Protein–RNA interactions for Protein: Q92952

KCNN1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN1Q92952 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNN1Q92952 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms