Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113Q902F9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms