Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP0

TTC13, Tetratricopeptide repeat protein 13, humanhuman

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Length 860 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13Q8NBP0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TTC13Q8NBP0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TTC13Q8NBP0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TTC13Q8NBP0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TTC13Q8NBP0 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TTC13Q8NBP0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TTC13Q8NBP0 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TTC13Q8NBP0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TTC13Q8NBP0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TTC13Q8NBP0 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC13Q8NBP0 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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