Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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CLDN19Q8N6F1 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN19Q8N6F1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN19Q8N6F1 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN19Q8N6F1 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN19Q8N6F1 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLDN19Q8N6F1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLDN19Q8N6F1 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLDN19Q8N6F1 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLDN19Q8N6F1 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLDN19Q8N6F1 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN19Q8N6F1 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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