Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms