Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms