Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms