Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR2Q2VWA4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
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