Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms