Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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E2F4Q16254 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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E2F4Q16254 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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E2F4Q16254 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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E2F4Q16254 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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E2F4Q16254 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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