Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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ZFHX3Q15911 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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ZFHX3Q15911 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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ZFHX3Q15911 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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ZFHX3Q15911 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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ZFHX3Q15911 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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ZFHX3Q15911 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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ZFHX3Q15911 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC003688.2-201ENST00000576271 415 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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