Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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CYTH1Q15438 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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CYTH1Q15438 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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CYTH1Q15438 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYTH1Q15438 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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