Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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