Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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