Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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