Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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