Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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AP1B1Q10567 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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AP1B1Q10567 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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AP1B1Q10567 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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