Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms