Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms