Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms