Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms