Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
RPS29P62273 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
RPS29P62273 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
RPS29P62273 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
RPS29P62273 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
RPS29P62273 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
RPS29P62273 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
RPS29P62273 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
RPS29P62273 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
RPS29P62273 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
RPS29P62273 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
RPS29P62273 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
RPS29P62273 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RPS29P62273 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms