Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHBP55084 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHBP55084 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHBP55084 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHBP55084 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHBP55084 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHBP55084 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHBP55084 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHBP55084 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHBP55084 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHBP55084 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHBP55084 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHBP55084 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHBP55084 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHBP55084 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHBP55084 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHBP55084 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHBP55084 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms