Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms