Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RECQLP46063 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RECQLP46063 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RECQLP46063 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RECQLP46063 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RECQLP46063 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RECQLP46063 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RECQLP46063 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RECQLP46063 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RECQLP46063 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RECQLP46063 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RECQLP46063 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RECQLP46063 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RECQLP46063 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RECQLP46063 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RECQLP46063 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RECQLP46063 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RECQLP46063 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms