Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPD2P43304 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPD2P43304 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPD2P43304 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPD2P43304 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPD2P43304 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPD2P43304 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPD2P43304 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPD2P43304 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPD2P43304 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPD2P43304 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPD2P43304 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPD2P43304 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPD2P43304 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPD2P43304 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPD2P43304 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GPD2P43304 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPD2P43304 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPD2P43304 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPD2P43304 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPD2P43304 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPD2P43304 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPD2P43304 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPD2P43304 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPD2P43304 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPD2P43304 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPD2P43304 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPD2P43304 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPD2P43304 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPD2P43304 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPD2P43304 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPD2P43304 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPD2P43304 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPD2P43304 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPD2P43304 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPD2P43304 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPD2P43304 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPD2P43304 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPD2P43304 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPD2P43304 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPD2P43304 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms