Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CTSSP25774 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTSSP25774 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTSSP25774 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTSSP25774 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTSSP25774 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTSSP25774 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CTSSP25774 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTSSP25774 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTSSP25774 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTSSP25774 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTSSP25774 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTSSP25774 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTSSP25774 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTSSP25774 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTSSP25774 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTSSP25774 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms