Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4AP04350 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB4AP04350 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB4AP04350 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB4AP04350 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB4AP04350 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB4AP04350 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4AP04350 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4AP04350 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4AP04350 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4AP04350 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms