Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC131902.1-201ENST00000521558 594 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMINO43313 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 R3HCC1L-206ENST00000613938 1397 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 WDYHV1-201ENST00000287387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 LMO7DN-201ENST00000318245 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AL359918.2-201ENST00000412311 497 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC003075.1-208ENST00000415246 596 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 OR4A48P-201ENST00000531359 391 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMINO43313 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 SERPINA9-201ENST00000298845 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMINO43313 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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