Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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