Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARVCFO00192 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARVCFO00192 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARVCFO00192 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARVCFO00192 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARVCFO00192 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARVCFO00192 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARVCFO00192 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARVCFO00192 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARVCFO00192 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARVCFO00192 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARVCFO00192 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARVCFO00192 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms