Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms