Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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