Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms