Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms