Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms