Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms