Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PNPLA8Q9NP80 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms