Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms