Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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C9orf16Q9BUW7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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C9orf16Q9BUW7 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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C9orf16Q9BUW7 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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C9orf16Q9BUW7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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