Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 KCNH1-209ENST00000639952 8075 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CACNA1C-205ENST00000399591 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CACNA1C-206ENST00000399595 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CACNA1C-207ENST00000399597 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CACNA1C-208ENST00000399601 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CACNA1C-217ENST00000399641 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CACNA1C-218ENST00000399644 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms