Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms