Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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