Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms