Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRNP3Q8WYN3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms